Etap 1:
Izolacja materiału i tworzenie kolekcji szczepów Salmonella
Wprowadzenie
Etap 1 projektu miał na celu zebranie i zabezpieczenie odpowiednich materiałów biologicznych oraz utworzenie banku szczepów Salmonella. Ten etap obejmował okres od 16 października 2023 do stycznia 17 stycznia 2024 roku i składał się z kilku kluczowych zadań, takich jak pobór prób środowiskowych, zabezpieczenie materiałów oraz utworzenie kolekcji szczepów bakterii do dalszych badań nad bakteriofagami.
Przygotowanie kolekcji szczepów Salmonella
Przed rozpoczęciem głównych działań projektu wykonano dodatkowe posiewy mikrobiologiczne na płytki z podłożem LA (agaru odżywczego), aby utrzymać bank szczepów Salmonella pochodzących z różnych instytucji. W tym celu zabezpieczono szczepy poprzez przechowywanie ich w dwóch formach:
- Skosy agarowe na podłożu do przechowywania szczepów wzorcowych.
- Konserwy w glicerolu, przechowywane w temperaturze -80˚C.
Pobór materiału badawczego
- Ścieki komunalne (zbierane z oczyszczalni).
- Odchody ptaków z obiektów przemysłowego chowu drobiu.
- Wodę ze stawów i gleby z terenów bytowania dzikiego oraz hodowlanego ptactwa.
Zabezpieczenie materiału badawczego
Po pobraniu materiału przystąpiono do jego zabezpieczenia. Odchody ptaków oraz gleba zostały rozporcjowane, zawieszone w buforze TM i poddane homogenizacji. Próby te były zabezpieczone przed światłem słonecznym i przechowywane w temperaturze +4°C. Próby wody pobrane z różnych zbiorników wodnych były zagęszczane przez podgrzewanie i odparowywanie w kontrolowanych warunkach.
Utworzenie kolekcji szczepów
Na zakończenie pierwszego etapu wszystkie zgromadzone próbki zostały odpowiednio skatalogowane, przechowywane i zabezpieczone. Kolekcja szczepów Salmonella została w pełni opracowana, a wszystkie szczepy umieszczono w warunkach, które zapewnią ich trwałość i bezpieczeństwo w przyszłych badaniach.
Podsumowanie
Etap 1 projektu zakończył się sukcesem, dzięki któremu zgromadzono pełną kolekcję materiałów badawczych oraz wyselekcjonowano szczepy Salmonella, które będą podstawą do kolejnych etapów badań nad bakteriofagami.